Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms