Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
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Cabp1Q9JLK7 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
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Cabp1Q9JLK7 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Cabp1Q9JLK7 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Cabp1Q9JLK7 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp1Q9JLK7 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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