Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERV1

Mkrn2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn2Q9ERV1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mkrn2Q9ERV1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mkrn2Q9ERV1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mkrn2Q9ERV1 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Mkrn2Q9ERV1 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Mkrn2Q9ERV1 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Mkrn2Q9ERV1 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Mkrn2Q9ERV1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mkrn2Q9ERV1 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms