Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snap29Q9ERB0 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms