Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms