Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC69

Ndufa9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa9Q9DC69 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ndufa9Q9DC69 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms