Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms