Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SrpraQ9DBG7 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms