Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms