Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdzd9Q9D9M4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms