Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Snx5Q9D8U8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Snx5Q9D8U8 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Snx5Q9D8U8 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Snx5Q9D8U8 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Snx5Q9D8U8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Snx5Q9D8U8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Snx5Q9D8U8 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Snx5Q9D8U8 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Snx5Q9D8U8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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