Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms