Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Nop56Q9D6Z1 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Nop56Q9D6Z1 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Nop56Q9D6Z1 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Nop56Q9D6Z1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Nop56Q9D6Z1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Nop56Q9D6Z1 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Nop56Q9D6Z1 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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