Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ttc9bQ9D6E4 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ttc9bQ9D6E4 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ttc9bQ9D6E4 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ttc9bQ9D6E4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ttc9bQ9D6E4 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ttc9bQ9D6E4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ttc9bQ9D6E4 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ttc9bQ9D6E4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ttc9bQ9D6E4 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ttc9bQ9D6E4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ttc9bQ9D6E4 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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