Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Ribc2Q9D4Q1 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Ribc2Q9D4Q1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Ribc2Q9D4Q1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
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Ribc2Q9D4Q1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Ribc2Q9D4Q1 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ribc2Q9D4Q1 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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