Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx29Q9D3S3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms