Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx20Q9D2Y5 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx20Q9D2Y5 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx20Q9D2Y5 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx20Q9D2Y5 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx20Q9D2Y5 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx20Q9D2Y5 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx20Q9D2Y5 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx20Q9D2Y5 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx20Q9D2Y5 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms