Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9D2Q3 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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