Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Trappc6bQ9D289 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Trappc6bQ9D289 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Trappc6bQ9D289 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Trappc6bQ9D289 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc6bQ9D289 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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