Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1K7

UPF0687 protein C20orf27 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1K7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D1K7 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms