Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms