Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms