Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms