Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl11Q9CXW4 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms