Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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Sgo1Q9CXH7 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Sgo1Q9CXH7 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Sgo1Q9CXH7 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Sgo1Q9CXH7 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Sgo1Q9CXH7 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Sgo1Q9CXH7 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Sgo1Q9CXH7 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Sgo1Q9CXH7 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Sgo1Q9CXH7 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Sgo1Q9CXH7 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Sgo1Q9CXH7 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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