Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms