Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

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Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tdrd12Q9CWU0 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Tdrd12Q9CWU0 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms