Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhobtb3Q9CTN4 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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