Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms