Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms