Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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