Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DenrQ9CQJ6 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms