Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nudt21Q9CQF3 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms