Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms