Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
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Rab5aQ9CQD1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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Rab5aQ9CQD1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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Rab5aQ9CQD1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
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Rab5aQ9CQD1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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Rab5aQ9CQD1 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
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Rab5aQ9CQD1 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Rab5aQ9CQD1 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rab5aQ9CQD1 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rab5aQ9CQD1 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rab5aQ9CQD1 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rab5aQ9CQD1 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rab5aQ9CQD1 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
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