Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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