Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup155Q99P88 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms