Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms