Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ciao1Q99KN2 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms