Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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