Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms