Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Apobec3Q99J72 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms