Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Smim11aQ99J19 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Smim11aQ99J19 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim11aQ99J19 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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