Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ctu1Q99J10 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ctu1Q99J10 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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