Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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