Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Usp3Q91W36 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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