Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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