Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Dnajc28Q8VCE1 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Dnajc28Q8VCE1 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Dnajc28Q8VCE1 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Dnajc28Q8VCE1 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Dnajc28Q8VCE1 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Dnajc28Q8VCE1 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Dnajc28Q8VCE1 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Dnajc28Q8VCE1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Dnajc28Q8VCE1 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Dnajc28Q8VCE1 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Dnajc28Q8VCE1 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Dnajc28Q8VCE1 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dnajc28Q8VCE1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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