Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
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Vmn1r200Q8R281 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Vmn1r200Q8R281 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Vmn1r200Q8R281 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vmn1r200Q8R281 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vmn1r200Q8R281 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vmn1r200Q8R281 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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Vmn1r200Q8R281 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vmn1r200Q8R281 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vmn1r200Q8R281 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vmn1r200Q8R281 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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Vmn1r200Q8R281 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vmn1r200Q8R281 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
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Vmn1r200Q8R281 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Vmn1r200Q8R281 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Vmn1r200Q8R281 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Vmn1r200Q8R281 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Vmn1r200Q8R281 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vmn1r200Q8R281 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r200Q8R281 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r200Q8R281 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r200Q8R281 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Vmn1r200Q8R281 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Vmn1r200Q8R281 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r200Q8R281 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Vmn1r200Q8R281 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r200Q8R281 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r200Q8R281 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Vmn1r200Q8R281 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r200Q8R281 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r200Q8R281 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Vmn1r200Q8R281 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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