Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prpf39Q8K2Z2 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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